Igienizarea implica o curatare acida a tuturor elementelor instalatiei, fiind practic demontate si curatate toate componentele acesteia (vaporizator, ventilator unitate interna, carcase, tava condens filtre, condensator) efectuandu-se urmatoarele etape: curatare filtre, demontare unitate interioare, igienizarea componentelor (vaporizator, ventilator unitate interna, tava condens), curatare condensator unitate exterioara, curatare si igienizare carcasa plastic. Curatarea acida profesionala impiedica dezvoltarea bacteriilor si mucegaiului. Pentru igienizare se vor folosi doar agenti de curatare profesionali dedicati acestor operatii. Rezultatul unei igienizari profesionale complete a instalatiei de aer conditionat este distrugerea coloniilor de bacterii dezvoltate in urma folosirii aparatelor de aer conditionat care creaza conditii optime de dezvoltare a coloniilor de bacterii (umezeala si temperaturi cuprinse in 25-45 grd C), printre cele mai frecvente fiind bacteria Legionella.