AFIR isi desfasoara activitatea in cadrul a 2 sedii centrale in Bucuresti, 8 centre regionale - Iasi, Constanta, Targoviste, Craiova, Timisoara, Satu Mare, Alba, Bucuresti si 41 de oficii judetene in orase resedinta de judet. Agentia dispune de un numar de aproximativ 1800 de persoane. AFIR a obtinut in Iunie 2014 certificarea Sistemului de Management al Securitatii Informatiei conform cerintelor ISO/IEC 27001:2013 iar in Iunie 2017 s-a obtinut recertificarea pe acest standard pentru domeniul "Management of financing projects, the coordination and the control of payments towards the beneficiaries. Statement of Applicability - SoA 20150320/03.2015". In conditiile in care perioada de valabilitate a unui certificat ISO este de 3 ani, certificatul actual avand valabilitate pana la data de 11.06.2020, in vederea mentinerii continuitatii, se impune efectuarea auditului de recertificare anterior expirarii actualului certificat.